Банковское учреждение начало свою работу в 1989 г в качестве Паевого морского акционерного банка. Его учредителями являлись организации, работавшие в сфере водного транспорта. В 1992 г. оно было преобразовано в ОАО; в 1995 г. его форма ведения бизнеса сменилась на акционерное общество открытого типа. Впоследствии его она была изменена на ОАО, под которой он функционирует сегодня.
В 2005 г. в капитал банковской структуры вошли предприятия группы «Промышленные инвесторы», которые стали выступать в качестве ее основных акционеров. Ключевым собственником является С. Генералов, занимающий пост президента группы (в прошлом – министр топлива и энергетики Рооссийской Фередации).
В 2012 г. С. Генералов заключил сделку по продаже 56% акций транспортной группы FESCO за 1 миллиард долларов. Покупателем выступила группа «Сумма», принадлежавшая З. Магомедову. После смены акционера группой FESCO был изъят из Морского банка немалый объем депозитов. Вслед за этим фининститут получил финансовое вливание со стороны С. Генералова, разместившего в нем средства в размере 60 миллионов долларов.
Сегодня более 99% акций финучреждения владеет Агентство инвестиций и развития ТЭК, принадлежащее С. Генералову. Пост его главы совета директоров занимает старший вице-президент группы «Промышленные инвесторы» М. Лихачев.
Помимо главного офиса, банковский институт владеет 4 филиалами, расположенными в портовых городах страны, и 3 операционными офисами. Его штат персонала в 2014 г. составлял порядка трехсот сотрудников. Для держателей пластиковых карт установлено 13 банкоматов; они также имеют возможность воспользоваться устройствами Объединенной расчетной системы, насчитывающей около 45 тысяч банкоматов по всей стране.
Банковская структура специализируется на работе с организациями, занятыми в сфере морского и речного транспорта. Ее клиентская база включает в себя порядка 1,7 тысячи клиентов среди юридических лиц, для которых доступны следующие услуги:
Спектр услуг для физических лиц включает в себя: